Ban điều phối Ngành hàng cà phê Việt Nam (VCCB) có 01 trưởng ban, 02 phó trưởng ban, 12 ủy viên đại diện cho cả khối công và khối tư.
Theo Quyết định Thành lập Ban điều phối, giữ vị trí Trưởng Ban là một Thứ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn (BNNPTNT), hai Phó Trưởng Ban là Cục trưởng Cục Trồng trọt và Viện trưởng Viện Chính sách và Chiến lược Phát triển nông nghiệp nông thôn. 12 Ủy viên Ban điều phối là người đại diện cho các cơ quan, tổ chức, doanh nghiệp thuộc cả khối công và khối tư.
Hỗ trợ cho Ban điều phối có 01 văn phòng thường trực và 03 tiểu ban chuyên môn, nghiệp vụ: Tiểu ban Sản xuất, Tiểu ban Chế biến và Thương mại, Tiểu ban Chính sách và Bền vững.
Theo Quy chế Hoạt động Ban điều phối, mỗi tiểu ban có 01 Trưởng Tiểu ban, 01 Phó trưởng Tiểu ban, và các thành viên trong Tiểu ban. Các thành viên có thể bao gồm đại diện không thuộc Ban điều phối, do các Trưởng Tiểu ban đề xuất, được Ban điều phối mời dựa trên sự tham gia tự nguyện.